Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms