Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim40Q3UWA4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms