Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm27235Q3UW50 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm27235Q3UW50 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm27235Q3UW50 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm27235Q3UW50 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm27235Q3UW50 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm27235Q3UW50 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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