Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb2Q3UUV9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms