Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms