Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms