Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B230104I21RikQ3USW4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms