Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6899Q3USS0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms