Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc190Q3URK1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms