Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Acsf3Q3URE1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acsf3Q3URE1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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