Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec31aQ3UPL0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec31aQ3UPL0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec31aQ3UPL0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec31aQ3UPL0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Sec31aQ3UPL0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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