Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgef40Q3UPH7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgef40Q3UPH7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
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