Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms