Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms