Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog7Q3UM29 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms