Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp19Q3UJD6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms