Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnep1r1Q3UJ81 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms