Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf224Q3UIW8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rnf224Q3UIW8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rnf224Q3UIW8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf224Q3UIW8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf224Q3UIW8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf224Q3UIW8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf224Q3UIW8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf224Q3UIW8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms