Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Zyg11bQ3UFS0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zyg11bQ3UFS0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms