Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnft2Q3UF64 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnft2Q3UF64 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnft2Q3UF64 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnft2Q3UF64 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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