Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brf2Q3UAW9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms