Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf166Q3U9F6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf166Q3U9F6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf166Q3U9F6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf166Q3U9F6 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf166Q3U9F6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf166Q3U9F6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf166Q3U9F6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf166Q3U9F6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf166Q3U9F6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf166Q3U9F6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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