Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U7U4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U7U4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U7U4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms