Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms