Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sec24aQ3U2P1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec24aQ3U2P1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms