Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TraddQ3U0V2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TraddQ3U0V2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms