Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Palb2Q3U0P1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms