Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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