Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
D17Wsu92eQ3TT38 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D17Wsu92eQ3TT38 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms