Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fbxw18Q3TSA9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fbxw18Q3TSA9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms