Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TQQ9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TQQ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms