Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cwc27Q3TKY6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cwc27Q3TKY6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms