Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms