Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm1Q2TV84 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms