Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms