Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam178bQ24JP3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam178bQ24JP3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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