Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms