Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptcd3Q14C51 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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