Protein–RNA interactions for Protein: Q14B48

Ccdc129, Coiled-coil domain-containing protein 129, mousemouse

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc129Q14B48 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
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Ccdc129Q14B48 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc129Q14B48 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
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Ccdc129Q14B48 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Ccdc129Q14B48 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
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Ccdc129Q14B48 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
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Ccdc129Q14B48 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Ccdc129Q14B48 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Ccdc129Q14B48 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Ccdc129Q14B48 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Ccdc129Q14B48 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc129Q14B48 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms