Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf3ip1Q149C2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms