Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli2Q0VGT2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli2Q0VGT2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms