Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc162pQ0VG85 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms