Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim24Q0VG18 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms