Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ttc39dQ0VF76 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms