Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rundc1Q0VDN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms