Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrriq1Q0P5X1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrriq1Q0P5X1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms