Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NeblQ0II04 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms