Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms