Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd8Q09XV5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd8Q09XV5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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