Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssrp1Q08943 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms